ニコニコ大百科

この曲はハチさんが昔ニコ動にあげてた「whale orchestra（削除済み）」っていう曲のリメイクで、メロディーが同じだから確定（多分ストーリーは関係ない）。だからハチさんの「昔の曲を云々」っていう発言はそれ。

ここからは勝手な解釈だけど、「Persona Alice」の以後の話としてハチさんがニコ動にあげてた「Tinkle bell（削除済み）」っていう曲があるんだけど、それが少女（アリス）と助けに来た少年の話で、
「Christmas Morgue」で出てくる少女はアリス（仮）で間違いない。証拠としては作中で少女が一度も目を開いていないことから、盲目だと分かる。（「Persona Alice」にて少女が盲目だと分かっているので）

よって、〝あれから三年後〟は「Tinkle bell」から三年が経過していることが分かる。
「Christmas Morgue」の内容に関しては「Persona Alice」で助けに来た少年がこの〝三年〟の内に死に（作中で少年が黒く塗りつぶされていることから）、少年に別れを告げるアリス（仮）の話だと思う。